Primăvara, două fete se întâlnesc: Mato şi Yomi. Fiecare simte în cealaltă ceva ce îi lipseşte ei, şi sunt atrase una de alta în ciuda personalităţilor lor contrare. Deşi, ezitand iniţial, între ele se formează o legătură puternică. Dar ambele ascund secrete - şi într-o lume pustie, două fete luptă: Black Rock Shooter şi Dead Master. O fiinţă ciudată, Black Gold Saw, le priveşte misterioasa luptă, râzând. Aceasta este povestea a două fete, în două lumi, ademenite de căile destinului. (Banner: Misukaze)
Acum mult timp, Yoma, monştri ce-şi schimbă forma, s-au transformat în oameni pentru a trăi deghizaţi în oraşe umane, hrănindu-se cu ei în secret. O organizaţie secretă fără nume a descoperit o cale de a implanta carne de Yoma în oameni pentru a crea hibrizi destul de puternici pentru a-i învinge. Abilităţile de bază ale unui hibrid includ vindecare mai rapidă, modificare limitată a formei corpului, abilitatea de a detecta Yoma şi alţi hibrizi şi o creştere în întregime a puterilor fizice ce le permit să mânuiască săbii grele, pentru care sunt numite Claymore. Din motive necunoscute, doar femeile sunt alese să devină Claymore. De deseori sunt alese pentru implantare după ce devin singurele supravieţuitoare ale unor familii atacate de Yoma; asta le asigură loialitatea şi dorinţa de a îndura durerosul proces de transformare. (Banner: Misukaze)
Yukimura Chizuru a venit în Kyoto în căutarea tatălui ei, un doctor dat dispărut. Acolo, asistă la o luptă între un Oni şi Shinsengumi. Cei din Shinsengumi o iau în custodie, întrebându-se ce vor face cu ea, după ce au descoperit că e fiica doctorului pe care îl caută şi ei, de asemenea. Shinsengumi o iau apoi pe Chizuru în căutare, dând peste tot felul de aventuri. (Banner: KidoLoli)